QTSのバージョンが上がるにつれて動作が遅くなる

昨日までは両方とも全く同じファームウェア(QTS 5.2.6.3195)、アプリ等を実行していました。

根本的な原因はファームウェアQTS 5.2.6にあるはずです。このファームウェアは旧モデルで過度なパフォーマンス問題があることを確認しており、ウェブサイトから削除しました。QTS 5.2.6については以下のディスカッションを参照してください。

この古いTS-251+は捨てて、新しいモデルを買うべきでしょうか?

まず「NAS new」をQTS 5.2.5にダウングレードしてみてください。そうすれば「NAS old」と同じくらいスムーズになるはずです。