Apple自体がAFP関連の制限をいくつか設けており、英語のディスカッションフォーラムでも言及されています。
https://www.reddit.com/r/MacOS/comments/1negm9g/nas_for_time_machine_backups_apple_says_no_more/
redditで紹介されている解決策は、まずAFPを無効にしてからSMB3で試してみるというものです…
ただ、私自身はまだ仕事用のmacOSをアップデートしていませんし、仕事環境ではすぐにアップデートやテストをしたくない気持ちがあります…